Кнорре Д.Г., Мызина С.Д. Биологическая химия

3-е изд., испр. М: Высшая школа, 2000. - 479 с.В третьем издании учебника сохранены основные акценты, направленные на изложение структуры и свойств важнейших биополимеров, роли их пространственной организации в обеспечении специфичности биохимических процессов, роли ферментов в химических превращениях в живой природе, роли матричного бионосителя как пути обеспечения многообразия структур с помощью универсальных катализаторов.
Дополнительно включены вопросы, получившие развитие в последние годы, такие как рибозимы – ферменты на основе РНК, методы молекулярной селекции нуклеиновых кислот, динамические аспекты биологического катализа и компьютерные подходы к изучению структуры и функции биополимеров.
При рассмотрении экспериментальных методов биохимии усилено внимание к методам, порожденным самой биохимией, в особенности использованию матричных ферментов в фундаментальных и прикладных исследованиях.Уровни организации живой материи.
Молекулярный уровень организаций живой материи.
Клетка - основной структурный элемент живой материи. Клеточный уровень организации жизни.
Основные черты организации эукариотических клеток.
Многоклеточные организмы.
вные химические компоненты живых организмов.
Белки и их главные биологические функции.
Углеводы. Моносахариды и полисахариды. Запасные полисахариды. Клеточная стенка.
Нуклеиновые кислоты - носители наследственной информации.
Клеточные мембраны. Липиды.
Основные группы низкомолекулярных органических соединений в живой природе.
Элементный состав живой материи.
Пространственная структура биополимеров и их роль в обеспечении специфичности биохимических процессов. Нековалентные взаимодействия в биологических системах.
Основные типы нековалентных взаимодействий в живой природе.
Молекулярное узнавание в биохимических системах.
Пространственная структура белков.
Пространственная структура нуклеиновых кислот.
Самоорганизация пространственной структуры биополимеров.
Комплексы биополимеров. Многосубъединичные белки.
Двуспиральные нуклеиновые кислоты.
Нуклеопротеиды.
Направленные конформационные переходы в биополимерах.
Количественные закономерности специфических взаимодействий биополимер-лиганд.
Задачи.
Ферменты.
Оксидоредуктазы.
Трансферазы.
Гидролазы.
Лиазы.
Изомеразы.
Лигазы (синтетазы).
Кофакторы, коферменты и витамины.
Применение ферментов в медицине и биотехнологии.
Задачи.
Матричный биосинтез биополимеров.
ДНК - основной носитель наследственной информации.
Генетический код.
Общие принципы матричного биосинтеза.
Биосинтез ДНК (репликация).
Биосинтез РНК (транскрипция).
Биосинтез белков (трансляция).
Особые случаи репликации и транскрипции у вирусов.
Задачи.
Ферменты. Механизмы действия.
Активные центры ферментов.
Основные принципы кинетики ферментативных реакций.
Ингибирование и активация ферментов.
Рибозимы.
Динамические аспекты молекулярной энзимологии.
Задачи.
Методы исследования биополимеров.
Традиционные методы выделения и очистки биополимеров, используемые в физической и аналитической химии.
Аффинные методы выделения и очистки биополимеров.
Методы детекции биополимеров.
Иммуноанализ.
Молекулярная гибридизация и амплификация нуклеиновых кислот.
Определение молекулярной массы биополимера.
Определение первичной структуры белков.
Определение первичной структуры нуклеиновых кислот.
Химический синтез полипептидов и белков.
Химический синтез олиго- и полинуклеотидов.
Генетическая инженерия.
Молекулярная селекция нуклеиновых кислот.
Рентгеноструктурный анализ биополимеров.
Двумерная ЯМР-спектроскопия биополимеров.
Пространственная структура биополимеров по данным молекулярной механики и молекулярной динамики.
Химические методы изучения пространственной структуры биополимеров.
Аффинная модификация биополимеров.
Задачи.
Основы биоэнергетики.
Общие принципы биоэнергетики.
колиз.
Окисление жирных кислот.
Цикл трикарбоновых кислот.
Цепь переноса электронов и окислительное фосфорилирование.
Биоэнергетическая эффективность окисления углеводов и жирных кислот.
Световые стадии фотосинтеза. Фотосинтетическое фосфорилирование.
Задачи.
Биохимические цепи и циклы.
Биосинтез моно- и полисахаридов.
Биосинтез жирных кислот и фосфолипидов.
Биосинтез липидов, построенных из изопентильных фрагментов. Биосинтез стероидов.
Метаболизм азота.
Биосинтез и биохимические превращения аминокислот.
Биосинтез нуклеотидов.
Биохимические цепи и циклы как общий принцип организации систем биохимических превращений в живой природе.
Задачи.
Регуляция систем биохимических процессов и пространственная организация биохимических процессов в клетке.
Стехиометрическая и аллостерическая регуляция систем биохимических процессов.
Химическая модификация как путь регуляции функциональной активности белков.
Регуляция транскрипции.
Компартментализация биохимических процессов.
Биохимические аспекты мышечного сокращения.
Ответы к задачам.
Приложение.
Рекомендуемая литература.
Предметный указатель.